Le Musée d’histoire naturelle se trouve à l’intérieur du Centre des visiteurs du Parc national du Circeo, Via Carlo Alberto 188 à Sabaudia. D’une surface d’environ 350 mètres carrés, il est conçu avant tout comme une structure d’information et de vulgarisation, destinée à faire découvrir au visiteur les valeurs environnementales, historiques et archéologiques de l’aire protégée et à l’orienter pour la suite de sa visite.
Le parcours n’est pas une exposition classique de collections scientifiques : il utilise des aménagements scénographiques et interactifs qui permettent d’écouter, toucher, observer et expérimenter. Dioramas, vidéos, postes tactiles, échantillons naturels, jeux interactifs et installations en trois dimensions présentent les cinq principaux milieux protégés par le Parc : la dune côtière, le promontoire du Circeo, les zones humides avec les quatre lacs et les zones marécageuses, la forêt de plaine et l’île de Zannone. Une section est aussi consacrée au patrimoine archéologique et historique du territoire.
Parmi les aménagements figure une représentation du sous-sol et de sa faune, avec les terriers et les milieux du renard, du porc-épic, du blaireau, de la belette, des fourmis et des scorpions. Le milieu marin et l’île de Zannone sont aussi présentés grâce à un petit aquarium. Le musée est pensé pour rendre la visite compréhensible et captivante pour les adultes, les enfants, les élèves, les familles et les personnes en situation de handicap physique ou psychique.